2029 год. В мире тотальной кибернетизации майор Мотоко Кусанаги ведет охоту на неуловимого хакера по прозвищу «Кукловод», способного взламывать человеческую память.
Погоня за преступником заставляет героиню усомниться в природе собственного «я», и вскоре она понимает: ответы на главные вопросы её существования может дать только сам враг.